[INDEX-MICR] MICrONS data | lunelukkio site

章一覧

[MICR-002] クイックスタート uv 入り・トークン保存済みの前提で、最短コマンドだけ並べた日常運用リファレンス。普段はまずこちらを開く
[MICR-001] 使い方ガイド (フル版) 前提環境 / セットアップ / 仮想環境のライフサイクル / CAVE 認証 / 起動 3 パターン / 対話プロンプト 5 ステップ / normalize モード (n/i/g) の詳細 / 出力 OBJ+MTL の Blender 取り込み / シナプス・細胞体クエリ / テスト実行 / トラブルシューティングを網羅

本ツールは以下の主要スクリプトで構成される:

ファイル	役割
`microns_DL.py`	CloudVolume から MICrONS minnie65 のセグメントメッシュをダウンロードし、Blender 等で扱える OBJ + MTL に変換する対話スクリプト
`microns_DB.py`	CAVE materialize テーブルから細胞体 (`nucleus_detection_v0`) と入力シナプス (`synapses_pni_2`) を取得するサンプル
`get_token.py` / `save_token.py`	CAVE 認証トークンの取得 (ブラウザフロー) と保存 (環境変数 `CAVE_TOKEN` 経由)
`verify_refactor.py`	`cv` をモック化したリグレッションテスト (6 件)
`main.py`	`microns_DL.process_microns_data()` を呼ぶエントリ点。`microns-data` コンソールスクリプトの実体